Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sh3bp1P55194 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms