Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms