Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P01648 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
P01648 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms