Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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