Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms