Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Hdac5Q9Z2V6 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Hdac5Q9Z2V6 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Hdac5Q9Z2V6 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hdac5Q9Z2V6 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms