Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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