Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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