Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc47Q9D024 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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