Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Fam20bQ8VCS3 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms