Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CipcQ8R0W1 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms