Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Dsg1bQ7TSF1 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Dsg1bQ7TSF1 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Dsg1bQ7TSF1 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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