Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms