Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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NipblQ6KCD5 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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NipblQ6KCD5 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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NipblQ6KCD5 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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NipblQ6KCD5 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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