Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Sft2d1Q5SSN7 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 CT033781.3-201ENSMUST00000221886 504 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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