Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Klhdc9Q3USL1 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Klhdc9Q3USL1 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Klhdc9Q3USL1 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Klhdc9Q3USL1 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Klhdc9Q3USL1 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Klhdc9Q3USL1 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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