Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Sez6-201ENSMUST00000000646 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr958-202ENSMUST00000215505 3514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 A930037H05Rik-203ENSMUST00000207446 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Il1rl2-201ENSMUST00000095020 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 1700020I14Rik-202ENSMUST00000153581 8300 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9159-201ENSMUST00000120661 566 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Afp-201ENSMUST00000042755 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Optn-201ENSMUST00000027986 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh16-213ENSMUST00000212882 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc15-201ENSMUST00000037275 3525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gnl3l-202ENSMUST00000112691 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gnl3l-201ENSMUST00000026297 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Pax9-203ENSMUST00000153250 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cog4-202ENSMUST00000165867 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Supt5-201ENSMUST00000003527 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp5-202ENSMUST00000114792 3858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gpihbp1-204ENSMUST00000189944 466 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37694-201ENSMUST00000191696 2133 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Psenen-202ENSMUST00000207031 316 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC140406.2-201ENSMUST00000227539 481 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38215-201ENSMUST00000192321 2233 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms