Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ctdnep1Q3TP92 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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