Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rpusd3Q14AI6 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms