Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms