Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Lmo4P61969 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms