Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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VdrP48281 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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VdrP48281 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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VdrP48281 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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VdrP48281 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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VdrP48281 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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VdrP48281 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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VdrP48281 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VdrP48281 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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