Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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SrprbP47758 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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SrprbP47758 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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SrprbP47758 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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SrprbP47758 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrprbP47758 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
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