Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.5 ms