Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
H2-Eb1P04230 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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