Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Ces2b-201ENSMUST00000059449 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms