Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 A430033K04Rik-202ENSMUST00000069862 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 AI182371-206ENSMUST00000226631 1680 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm42907-201ENSMUST00000199793 2148 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 AC164437.4-202ENSMUST00000228794 2413 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Slc2a9-210ENSMUST00000155634 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Srp72-201ENSMUST00000101087 3625 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Trim17-202ENSMUST00000075141 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm9776-201ENSMUST00000059598 2980 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 St6gal1-206ENSMUST00000178797 4177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Nup98-203ENSMUST00000210682 6694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SrfQ9JM73 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms