Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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