Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms