Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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