Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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