Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms