Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms