Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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