Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Snx17Q8BVL3 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx17Q8BVL3 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms