Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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NipblQ6KCD5 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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NipblQ6KCD5 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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