Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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