Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms