Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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