Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms