Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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