Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PctpP53808 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PctpP53808 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PctpP53808 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PctpP53808 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.9 ms