Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrprbP47758 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms