Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprmP28828 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC8.79□□□□□ -1
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PtprmP28828 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC8.79□□□□□ -1
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PtprmP28828 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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PtprmP28828 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprmP28828 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC8.78□□□□□ -1
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