Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RxraP28700 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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