Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms