Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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PdgfaP20033 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PdgfaP20033 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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