Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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