Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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Ccl20O89093 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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