Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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